Енциклопедія увиразнює перший досвід сучасної наукової реконструкції діяльності та звершень єдиного на українських теренах ХІХ — початку ХХ ст. вищого православного богословського навчального закладу, здійсненої крізь призму вивчення життя і творчості її видатних викладачів та вихованців. Видання містить понад 600 біографічних статей, написаних на підставі вивчення значного масиву джерел, у тому числі й уперше введених до наукового обігу. Працю присвячено 400-літтю Києво-Могилянської академії, спадкоємицею якої протягом ХІХ — початку ХХ ст. була Київська духовна академія.