Історія зі всесвіту NieR: Automata!

11941 рік н. е. Аби відвоювати Землю в машинних форм життя, четверо членкинь загону YoRHa здійснили висадку в Перл-Гарбор. За підтримки сил спротиву, відправлених на планету двісті років тому, вони рушають до ліфтової зали головного ворожого сервера, яка розташована на вершині гори Ка’ала.

Тим часом у Бункері Футаба та Йоцуба загнані в глухий кут Радою людства й командувачкою, які блокують усі запити на підтримку загону YoRHa, що опинився у вкрай скрутному становищі…

Але що може бути важливішим за успішне виконання операції?